7 мая  1934 года постановлением Президиума ВЦИК Биробиджанский национальный район преобразован в автономную Еврейскую национальную область.

Этот же год является годом основания Биробиджанского городского народного суда - сентябрь  1934 года.

15 мая 1935 года постановлением № 174 Президиума Облисполкома Биробиджанскому городскому народному суду было выделено отдельное помещение.

В штате городского суда в 1935 году состояли: народный судья, секретарь судебного заседания, секретарь канцелярии, машинистка, судебный исполнитель, судебный распорядитель, курьер-уборщица.

В 1934 году, с образованием Еврейской автономной области, Народный суд Биро-Биджанского национального района преобразуется в суд ЕАО. В это время на территории автономной еврейской национальной области (так в официальных документах тех лет упоминается ЕАО) действуют 3 районных народных суда: Бирского района, Блюхеровского, Смидовичского и города Биробиджана. Хотя этот статус на государственном уровне Биробиджан получил только в 1937 году, во всех официальных документах начала 30-х годов он упоминается именно как город. А суд административного центра ЕАО именовался Биробиджанским городским.

Биробиджанский районный суд ЕАО был образован 20 февраля 1980 года на основании решения исполкома Совета народных депутатов ЕАО.

С 2005 года Биробиджанский районный суд располагается в здании по ул. Пионерская, 32. 

Федеральным законом от 29 июня 2010 г. № 127-ФЗ «О создании Биробиджанского районного суда Еврейской автономной области и об упразднении некоторых судов Еврейской автономной области» создан Биробиджанский районный суд и упразднены Биробиджанский городской суд Еврейской автономной области и Биробиджанский районный суд Еврейской автономной области.

В юрисдикцию вновь созданного районного суда переданы вопросы осуществления правосудия упраздненных Биробиджанского городского и Биробиджанского районного судов Еврейской автономной области.

Указом Президента Российской Федерации от 24 марта 2011 года № 344 в Биробиджанский районный суд Еврейской автономной области назначены председатель суда, заместитель председателя суда и 19 судей.

Биробиджанский районный суд ЕАО начал свою деятельность 03 мая 2011 года согласно постановлению президиум суда Еврейской автономной области от первого апреля 2011 года.

До ноября 2016 года председателем суда являлся Александр Иванович Маняхин. В июле 2017 года суд возглавил Станислав Юрьевич Ушаков. 

С 1 июня 2018 года, в соответствии с изменениями в российском законодательстве, в районных судах Российской Федерации началось рассмотрение уголовных дел с участием присяжных заседателей. В Биробиджанском районном суде ЕАО первый такой процесс состоялся в марте 2019 года.

С марта 2021 года участники споров по гражданским и административным делам имеют право использовать новую примирительную процедуру – судебное примирение. Изменения в Гражданский процессуальный кодекс и Кодекс административного судопроизводства были внесены Федеральным законом от 26.07.2019 № 197-ФЗ. Регламент проведения судебного примирения утверждён постановлением Пленума Верховного Суда РФ от 31.10.2019 N 41. Первым судебным примирителем стала судья в отставке Анна Ивановна Слюсарь.

 С ноября 2024 года участники споров по гражданским и административным делам могут урегулировать конфликт не только с помощью судебных примирителей, но и медиаторов – независимых посредников.